Покидая Кремль, Владимир Путин успел внести в Госдуму поправки в закон об адвокатуре. Они упрощают для Росрегистрации возможность лишать адвокатов их статуса и запрашивать материалы, связанные с их деятельностью.
В декабре 2003 года Главное управление Минюста РФ по Москве вынесло предписание о прекращении статуса адвоката Ольги Артюховой. Мотив: обнаруженная у нее записка, "направленная на противодействие следствию". Артюхова была подвергнута обыску после встречи с подзащитным в "Матросской тишине". Адвокат утверждала, что ничего, кроме проекта позиции по одной из статей обвинения, изъятые бумаги не содержали. Квалификационная комиссия Адвокатской палаты Москвы в январе 2004 года отклонила представление Минюста РФ о лишении Артюховой статуса адвоката. Позже это решение подтвердил совет Адвокатской палаты Москвы, не усмотрев в ее действиях нарушений закона и профессиональной этики. Тем не менее, органы юстиции обратились в Пресненский суд Москвы. Почти полтора года Артюхова заявляла различные ходатайства по этому делу, пытаясь доказать свою правоту. Поэтому для ее коллег стало большой неожиданностью, когда в октябре 2005 года она сама обратилась в совет Адвокатской палаты Москвы с просьбой о прекращении адвокатского статуса. Свое решение Артюхова объяснила «изменившимися семейными обстоятельствами».
В сентябре 2005 года Генпрокуратура обратилась в Минюст с просьбой лишить адвокатского статуса всех защитников экс-главы ЮКОСа, которые якобы намеренно саботируют суд по делу Ходорковского - Юрия Шмидта, Елены Левиной, Дениса Дятлева, Антона Дреля, Игоря Михеева, Карину Москаленко, Владимира Сергеева и Альберта Мкртычева. В список не попал только главный адвокат Ходорковского Генрих Падва.
Вслед за этим органами Федеральной регистрационной службы были направлены представления о лишении адвокатского статуса одного из основных защитников Ходорковского Юрия Шмидта, а также Елены Левиной, Дениса Дятлова и Антона Дреля. Адвокатам ставилось в вину, что они "вступили в сговор с целью срыва процесса" в кассационной инстанции. Однако Адвокатские палаты Москвы и Санкт-Петербурга отказались сделать это, не найдя в действиях защитников никаких признаков дисциплинарного нарушения.
Совет адвокатской палаты Москвы в декабре 2005 года сохранил также статус адвоката Альберту Мкртычеву. Тогда процесс инициировала администрация колонии ЯГ 14/10 города Краснокаменска, где отбывает восьмилетнее наказание Ходорковский. Представители колонии утверждали, что в ходе общения со своим подзащитным 15 ноября 2005 года Мкртычев допустил нарушения, несовместимые со статусом адвоката.
По весьма неординарной причине пытались лишить адвокатского статуса Карину Москаленко – известнейшего юриста, представляющего интересы Ходорковского в Страсбургском суде. Росрегистрация с подачи генпрокурора поставила ей в вину нарушение профессиональной этики в виде непредставления надлежащей защиты клиенту. При этом Михаил Ходорковский никаких жалоб на адвоката не подавал, более того, в заявлении, сделанном из колонии в Чите, сказал, что "полностью удовлетворен" работой Москаленко. В июне 2007 года Совет адвокатской палаты Москвы отказался лишить ее статуса адвоката.